スロークエリログの有効化

my.cnfにて、

[mysqld]
long_query_time = 1　←(デフォルトの10秒から1秒に変更する)
log_queries_not_using_indexes　←必要に応じて追加(インデックスが使われていないクエリを見つける場合は便利)
log_slow_queries　←スロークエリログの有効化

を追加して、MySQLサーバを再起動すればOK。
スロークエリログは
MySQLサーバインストールディレクトリ/var/ホスト名-slow.log　
として出力される。