ユーザ毎の.sshディレクトリ参照場所の確認

# cat /etc/passwd
root:x:0:0:root:/root:/bin/bash
bin:x:1:1:bin:/bin:/sbin/nologin
daemon:x:2:2:daemon:/sbin:/sbin/nologin

右から二番目の設定がそれを表す。
rootなら、/root/.ssh、daemonなら/sbin/.sshを参照する。