hddから起動できなかった理由

理由はとっても簡単。
インストール直後はhdaからhddに同期を行っていたから。

# cat /proc/mdstat
Personalities : [raid1]
read_ahead 1024 sectors
md2 : active raid1 hda3[0] hdd3[1]
      979840 blocks [2/2] [UU]
md1 : active raid1 hda2[0] hdd2[1]
      37993600 blocks [2/2] [UU]
      [==>..................]  resync = 13.5% (5137940/37993600) finish=53.0min speed=10324K/sec
md0 : active raid1 hda1[0] hdd1[1]
      104320 blocks [2/2] [UU]
unused devices: 

同期中はこんな感じで、進捗が表示されてます。
これが終了して、ようやく完璧なRAID1ということ。
同期後は、hddからも起動できるようになった。