動かない・・・・。

■追記
上記の解決策判明。
MySQLの設定ファイルはmy.cnfというが、
どういうわけか、ソースインストールした場合は作成されない。
そこで、
# cd /usr/local/mysql/share/mysql
# cp my-huge.cnf /etc/my.cnf
/etc/my.cnfにて
[mysqld]
old-passwords　←追加（パスワードを4.0の形式に戻す）
というようにして、パスワードを4.0の形式に戻してやれば、
PHPからデータベースに接続できるようになった。
4.0形式じゃないとダメな理由は
クライアントが4.0でサーバが4.1の場合ということらしい。
というか、そもそもMySQLのクライアントとサーバってなんだろう？
4.1のソースパッケージをインストールしたんだからサーバは4.1なのだろうか。
じゃぁクライアントが4.0なのは何故だろうか・・・？
クライアントのバージョンは（libmysqlclient, libmysql.dll）に依存するようだ・・。