doxygen使用手順

■インストール
http://www.fides.dti.ne.jp/~oka-t/doxygen.html#install
↑
とかでよくね？
試してないからわからんけど。
■設定ファイルの生成
カレントディレクトリをソースコードの存在するディレクトリに移動。

$ doxygen -g

カレントディレクトリにDoxyfileが生成される。
■設定ファイルの修正

$ vi Doxyfile

お勧めの設定
INPUTにカレントディレクトリのフルパスを設定（ルートを設定したことになる）

例：INPUT = /home/tappe/hoge

RECURSIVEをYESに変更し、再帰的にディレクトリを検索するように設定

例：RECURSIVE = YES

EXCLUDEで除外したいディレクトリをフルパスで指定（相対で指定する方法あるのかな・・・・？）

例：EXCLUDE = /home/tappe/hoge/test
              /home/tappe/hoge/meso
↑/home/tappe/hoge/testと/home/tappe/hoge/mesoが除外される

パターンで除外させたいときはEXCLUDE_PATTERNSも併用する。
GENARATE_LATEXでLATEXの出力をやめる（今のところいらないので）

例：GENARATE_LATEX = NO

詳しくは↓で
http://www.doxygen.jp/starting.html
■doxygenの実行

$ doxygen Doxyfile

カレントディレクトリにhtmlディレクトリが生成され、その中になんかドキュメントができる。